Η Πατριαρχική Μονή Αγίας Τριάδας Τσαγκαρόλων είναι ένα από τα σημαντικότερα μοναστήρια του τέλους της Βενετικής Αυτοκρατορίας στην Κρήτη με μεγάλη συμβολή στην Ιστορία και την Εκπαίδευση του νησιού. Βρίσκεται στους πρόποδες της οροσειράς του Σταυρού, στην περιοχή "Τζωμπομίλος" του ακρωτηρίου Μέλεχα.
Η Μονή Γουβερνέτου ή η Κυρία των Αγγέλων είναι ένα από τα παλαιότερα μοναστήρια της Κρήτης και αποτελεί δείγμα ορθόδοξης μονιστικής αρχιτεκτονικής. Χτίστηκε το 1537 σε υψόμετρο 260 μέτρων από μοναχούς της καθολικής εκκλησίας που εγκατέλειψαν τη θέση λόγω πειρατείας.
Το μοναστήρι του Τιμίου Προδρόμου βρίσκεται στις Κορακίες Ακρωτηρίου. Πρόκειται για ένα πανί της ιστορικής γυναίκας που είναι γνωστό στους ντόπιους ως μοναστήρι μοναχών. Το μοναστήρι καταστράφηκε πολλές φορές από τους διάφορους κατακτητές της Κρήτης και έτσι χάθηκαν τα πολύτιμα αρχεία που θα μπορούσαν να βοηθήσουν στην ακριβή χρονολόγηση του μοναστηριού.
Η Πατριαρχική Μονή Χρυσοπηγής ιδρύθηκε στα Χανιά κατά την τελευταία περίοδο της Ενετικής περιόδου (τέλη 16ου αιώνα) και είναι αφιερωμένη στην Παναγία Ζωοδόχο Πηγή. Κάθε χρόνο έρχονται χιλιάδες προσκυνητές από την Ελλάδα και το εξωτερικό για να γονατίζουν τη θαυματουργή εικόνα της Παναγίας.
Η Μονή Χρυσοσκαλίτισσας είναι αφιερωμένη στην Παναγία και είναι ιδιαίτερα θαυμασμένη από όλους τους επισκέπτες. Το μοναστήρι ανεβαίνει πάνω σε βράχο 35 μ. Πάνω από τη θάλασσα. Μέσα στα τείχη της μονής βρίσκεται η εικόνα της Παναγίας, η οποία λέγεται ότι έχει πάνω από χίλια χρόνια.
Στο κέντρο των Χανίων κυριαρχεί το ιστορικό Τμημάρτηρι, ο Καθεδρικός Ναός των Χανίων, ο Ναός των Εισοδίων της Θεοτόκου. Ως μητροπολιτικός ναός θεωρείται και προστάτης της πόλης, όπου επικεντρώνεται το θρησκευτικό και γενικό αφοσιωμένο ενδιαφέρον του θεϊκού πληθυσμού των Χανίων. Η εκκλησία είναι αφιερωμένη στον Ευαγγελισμό της Θεοτόκου και η κατασκευή αυτής της εκκλησίας ολοκληρώθηκε το 1860.
Ανατολικά της πλατείας Σπλάτζια της παλιάς πόλης των Χανίων βρίσκεται η εκκλησία του Αγίου Νικολάου, που χτίστηκε πριν από το 1320, κατά τη Βενετική περίοδο, ως μοναστήρι Δομινικανής Τάξης. Κατά τη Βενετοκρατία αποτελούσε τη σημαντικότερη εκκλησία της πόλης.
Η Καθολική Εκκλησία του Αγίου Φραγκίσκου είναι η μεγαλύτερη βενετσιάνικη εκκλησία της πόλης. Αργότερα, οι Τούρκοι το μεταμόρφωσαν σε τζαμί και τώρα φιλοξενεί το Αρχαιολογικό Μουσείο Χανίων.
